Phòng Tổ chức - Hành chính có chức năng tham mưu giúp Giám đốc Trung tâm Y tế tổ chức thực hiện công tác Tổ chức cán bộ - Hành chính quản trị và công tác Tài chính - kế toán.
Phòng Nghiệp vụ có chức năng tham mưu giúp Ban Giám đốc TTYT xây dựng chương trình công tác, kế hoạch hoạt động chuyên môn, nghiệp vụ của TTYT. Tổ chức chỉ đạo công tác nghiệp vụ chuyên môn của đơn vị theo kế hoạch được duyệt.
Thực hiện giám sát thường xuyên và quản lý chặt chẽ diễn biến tình hình các bệnh truyền nhiễm gây dịch trên địa bàn; tổ chức triển khai các hoạt động phòng, chống dịch bệnh;
Tổ chức điều tra định kỳ tình hình các bệnh truyền nhiễm gây dịch và các bệnh không lây tại các TYT và tại cộng đồng trên địa bàn thị xã;
Tổ chức triển khai các hoạt động phòng, chống HIV/AIDS, hướng dẫn quản lý, chăm sóc người nhiễm HIV tại gia đình và cộng đồng; phối hợp với bệnh viện trên địa bàn trong quản lý công tác điều trị HIV/AIDS;
Quản lý các ổ dịch cũ, phát hiện kịp thời ổ dịch mới; tiến hành các biện pháp chuyên môn, kỹ thuật để ngăn chặn dịch phát sinh, lây lan;
Tổng hợp số liệu, lập bản đồ, biểu đồ các loại bệnh dịch nguy hiểm, HIV/AIDS tại địa phương;
Triển khai thực hiện chương trình mục tiêu y tế, các dự án liên quan về y tế dự phòng, phòng, chống bệnh không lây, HIV/AIDS trên địa bàn.
Lập kế hoạch, cung cấp và bảo đảm số lượng, chất lượng thuốc thông thường và thuốc chuyên khoa...
Chức năng và nhiệm vụ: Xây dựng kế hoạch và tổ chức thực hiện các hoạt động phòng, chống bệnh nghề nghiệp
Khoa Khám bệnh - Chăm sóc sức khoẻ sinh sản và điều trị Methadone là khoa lồng ghép chịu sự lãnh đạo trực tiếp của Ban Giám đốc TTYT. Khoa Khám bệnh - Chăm sóc sức khoẻ sinh sản và điều trị Methadone có chức năng quản lý và tham mưu cho Ban Giám đốc TTYT về toàn bộ công tác của hoạt động chuyên môn của khoa theo quy định.