Phòng Nghiệp vụ có chức năng tham mưu giúp Ban Giám đốc TTYT xây dựng chương trình công tác, kế hoạch hoạt động chuyên môn, nghiệp vụ của TTYT. Tổ chức chỉ đạo công tác nghiệp vụ chuyên môn của đơn vị theo kế hoạch được duyệt. Đôn đốc và kiểm tra các khoa/phòng, trạm Y tế xã, phường và phòng khám ĐKKV Tân Hải thực hiện Quy chế chuyên môn và các quy định pháp luật về Dự phòng, Dân số - KHHGĐ, Khám chữa bệnh hiện hành;
Tham mưu Ban Giám đốc TTYT xây dựng Đề án, kế hoạch cải tiến chất lượng khám chữa bệnh, theo Bộ tiêu chí đánh giá chất lượng của Bộ Y tế. Tổ chức chỉ đạo, triển khai thực hiện và theo dõi, giám sát, tổng kết hoạt động cải tiến chất lượng toàn TTYT.